Harkov Tıp Üniversitesi bünyesinde dünyanın en gelişmiş eğitim sistemi olan Bologna eğitim sistemi uygulanmaktadır. Bologna eğitim sistemi günümüzde pek çok üniversitede uygulanma aşamasında olsada bu alanda aktif bir şekilde en iyi başarıya ulaşmış ülkelerden biri olan Ukrayna’da yer alan Harkov Tıp Üniversitesinde Blogna eğitim sistemi kapsamlı bir şekilde uygulamadadır.
Harkov Milli Tıp Üniversitesi 1805 yılında kurulmuştur ve 200 yılı aşkın süredir eğitim veren oldukça köklü bir okuldur. Okula başvuran öğrencilerden istenenler arasında sınav sonuç belgesi yer almamaktadır. Yani üniversitenin bir tavan veya taban puanı değerlendirmesi yoktur. Harkov Milli Tıp Üniversitesi kendilerine başvuran öğrencilerden lise diploması talep etmektedir. Üniversitenin diploması için YÖK Denkliği bulunmaktadır.